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STR檢測服務(wù)來分析分析STR的原理

  • 發(fā)布日期:2017-11-20      瀏覽次數(shù):3630
    •    STR檢測服務(wù)來分析分析STR的原理
        短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat, STR),也稱微衛(wèi)星 DNA(microsalite DNA) ,是由2 - 6個堿基對作為核心單位,串聯(lián)重復(fù)形成的一類DNA序列,由于核心單位重復(fù)數(shù)目在個體間呈高度變異性并且數(shù)量豐富,構(gòu)成了STR基因座的遺傳多態(tài)性。它分布于人類整個基因組,平均每15 kb就存在一個STR基因座。人類基因組內(nèi)已發(fā)現(xiàn)了七千個以上的STR位點。它具有分布廣泛,易于檢測,信息量大,有高度多態(tài)性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優(yōu)點。是繼限制性片段長度多態(tài)性 (RFLP) 之后的第二代遺傳記,目前STR分析已廣泛應(yīng)用于遺傳制圖、連鎖性分析、法醫(yī)學(xué)鑒定、疾病基因定位、物種多態(tài)性和遺傳病的診斷等諸多領(lǐng)域。
        微衛(wèi)星(STR)檢測服務(wù)流程
        1. 客戶提供
        A.如果提供基因組DNA:至少提供100 ng DNA樣品(針對每個多態(tài)性位點,需樣品3-5 ul,濃度為30 - 50 ng/ul)
        B.如果提供PCR產(chǎn)物:產(chǎn)物要通過預(yù)實驗的電泳檢測,特異性要好
        C.如果需要設(shè)計引物,請?zhí)峁┠康钠涡蛄谢蛘呶⑿l(wèi)星檢測位點,引物設(shè)計好后需要客戶確認(rèn)。
        D.除提供樣品類型,DNA濃度和純度值外,還需要注明可能殘留的抑制劑成分。樣品溶解在ddH2O中,如果不是,請注明溶解液成分。
        2. 確定STR位點,設(shè)計實驗方案,包括熒光標(biāo)記的選擇,引物的設(shè)計、合成和標(biāo)記,熒光分子量內(nèi)標(biāo)的選用等。
        3. 按照所設(shè)計的實驗方案完成熒光PCR,利用瓊脂糖電泳檢測結(jié)果;若PCR產(chǎn)物特異性不夠,將進(jìn)行優(yōu)化。
        4. PCR產(chǎn)物通過ABI 3730XL 測序儀器進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測,獲得擴(kuò)增片段大小的數(shù)據(jù)
        5. 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析,將產(chǎn)物片段大小、數(shù)量多少的信息轉(zhuǎn)化成直觀準(zhǔn)確的波形圖譜,為下一步進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數(shù)據(jù)。
        6.發(fā)送準(zhǔn)確的微衛(wèi)星(STR)分型結(jié)果報告及PCR產(chǎn)物。